新登陸的中長期在留者，原則上在登陸的機場或海港發給在留卡。此外，對于已經作為中長期在留者在日本居住的人，在留期限延長許可申請、在留資格變更許可申請、在留資格取得許可申請、在留資格申請在地方出入境管理事務所獲得永住許可后，申請變更居住地以外的在留卡時，申請更新在留卡的有效期時，將發給新的在留卡在留卡遺失或損壞等申請補發時。
因在留期限的延長許可等而簽發在留卡、在留卡的更新申請、因遺失或損壞而重新簽發的申請時，無需支付在留卡的簽發相關費用， etc. 如果想換在留卡的話，需要考慮到實際發生的費用，收取手續費（1,600 日元）。
